Толковый словарь Ушакова
ЗЁРНЫШКО — ЗЁРНЫШКО ЗЁРНЫШКО, зёрнышка, мн. зёрнышки, зёрнышек, зёрнышкам, ср. (разг.). уменьш.-ласк. к зерно в 1 и 3 знач. Яблочное зернышко. Толковый словарь Ушакова. Д.Н. Ушаков. 1935-1940.
Современный толковый словарь русского языка Ефремовой
Зернышко — зёрнышко ср. разг. 1. уменьш. к сущ. зерно I 2. ласк. к сущ. зерно I Толковый словарь Ефремовой. Т. Ф. Ефремова. 2000.
см. также морфологический разбор слова "зернышко".